大陆方面：企业首先要在商务部的 “对外贸易经营者备案系统” 完成备案登记，获取合法的对外贸易经营资格。同时，需向海关申领报关单位注册登记证书，以便顺利开展报关业务。若涉及特殊商品，如食品、化妆品、医疗器械等，还必须取得相应的生产许可证、经营许可证以及检验检疫证明等资质文件。例如，食品企业需获得食品生产许可证，化妆品企业要取得化妆品生产许可等。

台湾方面：台湾地区要求进口商向 “财政部关务署” 申请厂商编号，作为进口货物的身份标识。对于特定商品，像医疗器械、农药、部分电子产品等，进口商还需通过 “经济部国际贸易局” 办理进口许可。此外，两岸贸易逐步推行电子化，企业需接入电子数据交换（EDI）系统，实现报关单证的标准化、电子化传输，提高通关效率。

核心单证：商业发票、装箱单、原产地证明及提单是必不可少的文件。商业发票应详细注明货物的名称、规格、数量、单价、总价等信息，并加盖公司公章，建议注明 “台湾进口” 字样；装箱单需准确反映货物的包装情况，包括包装材质、件数、重量、体积等，且与实际货物完全一致；原产地证明根据商品类别选择 FORM A 或两岸经济合作框架协议（ECFA）原产地证书，若货物想享受早收清单零关税优惠，必须提交经海关签证的 ECFA 证书。

特殊商品单证：对于进口食品，台湾要求附上 “中文标识预审证明”，确保食品的中文标识符合当地规范；电子产品则需提供 “BSMI 认证” 复印件，证明产品符合台湾的标准及安全要求。企业可通过中国国际贸易促进委员会（CCPIT）或各地贸促会申办原产地证书，以保障文件的权威性和有效性。

关税政策：台湾关税遵循 “实质课税原则”，会依据商品在两岸的增值比例计算关税。部分从大陆进口的商品可能会被征收反倾销税或保障措施税，企业需提前通过 “海峡两岸关税查询系统” 等渠道，精准查询对应商品的关税税率。此外，两岸签署的 ECFA 协议涵盖 7000 余项商品实施零关税，企业应充分利用这一政策红利，核对自身出口商品是否符合条件，通过申请 ECFA 原产地证书降低关税成本。

增值税及其他税费：台湾实行 “反向征收” 制度，进口商需代缴 5% 的营业税（增值税）。除关税和增值税外，还有可能涉及检验费、仓储费、代理报关费等其他费用，企业在贸易合同中应明确各项费用的承担方，避免后续纠纷。在报价环节，建议预留 10 - 15% 的税费缓冲空间，以应对可能的税费波动。

运输方式：海运适合大宗商品运输，具有运量大、成本低的优势，但运输时间相对较长。企业需提前 7 - 10 天向具备两岸直航资质的船公司，如中远海运（COSCO）、长荣海运等订舱，确保舱位稳定。空运则适用于高价值、时效性强的货物，时效通常为 1 - 3 天，可选择 DHL、顺丰国际、华航、东航等航空公司或物流服务商。基隆、高雄、台北桃园是台湾主要的清关口岸，其中基隆港适合大宗货物清关，桃园机场则更适合高值商品。

包装与标识：货物包装需符合台湾的运输标准，对于易碎品，要添加足够的缓冲材料，防止运输途中受损；液体、粉末类货物必须使用防漏容器包装。同时，包装上应清晰标注收货人信息、货物名称、重量、体积以及 “台湾进口” 标识，以便于运输和清关识别。此外，台湾海关对木质包装有严格的熏蒸要求，若使用木质包装，必须提供 IPPC 专用标识，证明木质包装已进行熏蒸处理，符合检疫标准。

法律法规合规：严格遵守两岸的法律法规，严禁出口台湾禁止的商品，如武器弹药、毒品、濒危动植物制品等。同时，密切关注台湾 “标准检验局”“环保署” 等部门的规定，确保出口商品在质量、环保等方面符合要求。例如，电子产品需符合台湾的电气安全标准，包装材料需满足环保要求等。在贸易合同中，明确争议解决方式，建议约定适用中国大陆法律，并选择合适的争议解决机构，如约定台北仲裁委员会作为仲裁机构，利用 RCEP 区域法律协作机制维护自身权益。

申报风险防控：台湾海关查验率相对较高（约 15%），企业需如实申报货物信息，虚报价格将面临货值 1 - 3 倍的罚款。建议建立三方核对机制，由大陆供应商提供成本明细，台湾进口商确认申报价值，报关行进行合规审查，确保申报信息准确无误。对于纺织品等敏感商品，需提前申请配额，并留存完整的交易凭证。若遇到货物退运情况，必须在 30 日内办理复运手续，否则将产生每日 0.05% 的仓储费。此外，企业可投保 “两岸贸易信用保险”，覆盖政治风险与商业风险，降低贸易损失。

数字化与政策应对：台湾海关自 2022 年全面推行 “单一窗口” 系统，支持线上预申报、税费试算及进度追踪。大陆企业可对接 “中国国际贸易单一窗口” 平台，实现两岸数据互通。推荐使用智能报关软件，如 “云关通”“递一” 等，其 AI 审单功能可自动识别 HS 编码风险，降低错误率。对于频繁出口企业，建议申请台湾 “优良安全认证报关业者”（AEO）资质，享受优先查验、担保放行等便利措施。同时，关注台湾相关政策动态，如 “离岸风电产业国产化” 政策衍生的装备进口需求、“农业跨境电商” 试点带来的生鲜绿色通道、“数字内容产业” 合作中的版权物品跨境规则等，及时调整业务策略，把握政策红利。